Сперанская Анна Сергеевна

Сперанская

Анна Сергеевна

Должность

зав. лаб., ведущий научный сотрудник

Научная степень, звание

Кандидат биологических наук по специальности 03.01.04 (биохимия).

Образование и опыт

Окончила МГУ им М.В.Ломоносова, кафедра высших растений, по специальности «ботаника» в 1998 году

Компетенции

Высокопроизводительное секвенирование: полный цикл от выделения нуклеиновых кислот до анализа биоинформатических данных на приборах Illumina (HiSeq, MiSeq, Nextseq), Oxford Nanopore (PrometION, GridION), Thermo Fisher Scientific (Ion S5, Genexus).
Биоинформатика: сборка de novo бактериальных геномов, SNV анализ, филогенетический анализ последовательностей, анализ метагеномных данных, координация разработки ПО и БД (ITS растений, SARS-CoV-2) с последующим введением в эксплуатацию (VGARus).
Разработка наборов реагентов для высокопроизводительного секвенирования (в том числе документации, необходимой для производства).
Координация исследовательских и научно-практических проектов, в том числе, между разными организациями.

Сфера научных интересов

Идентификация и генетический анализ новых вирусов, в том числе, потенциально патогенных для человека, из млекопитающих и птиц.
Исследование двойных инфекций и суперинфекций SARS-CoV-2.
Разработка баз данных и алгоритмов для метагеномного анализа многокомпонентных биологических образцов
Разработка новых методов подготовки биологического материала к секвенированию.
Исследование ко-эволюции геномов патогенных вирусов и организмов хозяев. Исследование эволюции геномов симбиотических бактерий при адаптации организмов-хозяев к условиям занимаемых экологических ниш.