Версия для слабовидящих: Вкл Изображения: Вкл Размер шрифта: A A A Цветовая схема: A A A A

Наши публикации

2026

  1. Chudinov IK, Krinitsina AA, Petukhova DA, Lukina-Gronskaya AV, Korneenko EV, Gremyacheva VD, Kovalenko AV, Fedorov OV, Kozhemyakin GL, Mironov KS, Antipin MI, Butenko IO, Logacheva MD, Speranskaya AS. Proteogenomic investigation of plant constituents in herbal beverages. npj Sci Food 2026, 10: 99, doi: 10.1038/s41538-026-00747-1. IF=7,8, Q1.

  2. Matyushkina D, Lazareva A, Vasilyeva E, Polyakova A, Kovalenko A, Motyakin M, Butenko I, Ionova I, Sumarokova M, Pavlov R, Shcherbakova O, Tarasova M, Zavalko F, Svistunov A, Bashkirov P, Govorun V. When less is more: Cell size reduction as a metabolic lifeline in Mycoplasma gallisepticum. Front. Microbiol. 2026, 17:1825835, doi: 10.3389/fmicb.2026.1825835. IF=5,8, Q1.

  3. Neuberger A, Veretenenko II, Shalygin A, Trofimov YA, Gudermann Th, Chubanov V, Efremov RG, Sobolevsky AI. Open-channel block of human TRPV6 by polyamine spermine. Nat Comm, 2026, 17: 4720, 10.1038/s41467-026-73653-5, IF 15,7, Q1.

  4. Bagaeva DI, Demina GR, Panina IS, Krylov NA, Khrenova MG, Agaphonov MO, Savitsky AP, Efremov RG, Kaprelyants AS, Shleeva MO. MethyltransferaseCPmtA drives dormancy-associated synthesis of coproporphyrin III tetramethylether via a “carousel” mechanism in Mycobacterium smegmatis. International Journal of Biological Macromolecules, 2026, 358: 151714, doi: 10.1016/j.ijbiomac.2026.151714. IF=8,5, Q1.

  5. Serbina O, Schwager A, Kiseleva E, Dashinimaev E, Vorotelyak E, Vassetzky Y. Beyond myoblasts: DUX4 alters the differentiation landscape and promotes a pro-fibrotic phenotype in mesenchymal stromal cells. Cell Commun Signal, 2026, doi: 10.1186/s12964-026-03162-x. IF=11,6, Q1.

  6. Aliper ET, Ryzhov IM, Obukhova PS, Tuzikov AB, Galanina OE, Ziganshina MM, Sukhikh GT, Krylov NA, Henry SM, Efremov RG, Bovin NV. Immune antibodies recognizing the stem region of SARS-CoV-2 spike protein: Molecular modeling and in vitro study of synthetic peptides presentation to the antibodies. BBA – Biomembranes. 2026, 1868 (1): 184472, doi: 10.1016/j.bbamem.2025.184472, IF=8,4, Q1.

  7. Kovalchuk S, Arkhipova A, Melikhova A, Akhmetzyanova A, Vvedensky A, Savinova T, Ivkina A, Konanov D, Krivonos D, Mokhirev D, Benediktova Y, Fedorova L, Ilina E. Hybrid plasmids: genetic diversity and hypervirulent phenotype of Klebsiella pneumoniae. Front. Microbiol., 2026 17: 1768089, doi: 10.3389/fmicb.2026.1768089. IF=5,8, Q1.

  8. Chudinov I, Korneenko E, Rog I, Lukina-Gronskaya A, Kovalenko A, Gremyacheva V, Butenko I, Vasileva E, Matyshkina D, Litvinova E, Feoktistova N, Speranskaya A. Combined NGS and proteomics improves Viral diagnostics in wildlife: Coronaviruses confirmed in hedgehogs. Front Cell Infect Microbiol. 2026, 16:1814090, doi: 10.3389/fcimb.2026.1814090. IF=5,5, Q1.

  9. Serova OV, Gavrilenkova AA, Kuznetsov AS, Goryashchenko AS, Agisheva AR, Bershatsky YaV, Lushpa VA, Zangieva OT, Karbyshev MS, Gerasimov AS, Okhrimenko IS, Efremov RG, Deyev IE, Bocharov EV. Insulin receptor-related receptor activation byartificial double-ER mutations in the transmembrane domain. Int J Mol Sci, 2026, 27(10): 4364, 10.3390/ijms27104364, IF 4,9, Q1.

  10. Korneenko EV, Rog IS, Chudinov I, Kozyreva A, Sandanova EA, Pavlenko A, Matyushkina DS, Govorun VM. Genomic surveillance of the pneumonia outbreak caused by Mycoplasma pneumoniae among patients in Russia from January 2024 to June 2025. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 2026, Vol 16, doi:10.3389/fcimb.2026.1736929. IF=4,8, Q1.

  11.  Kozyreva AI, Akhmetzyanova A, Chudinov I, Kovalenko A, Rog I, Korneenko E, Vakaryuk A, Gremyacheva V, Butenko I, Govorun V. Characteristics ofSerratia rubidaea clinical strain revealed multiple resistance to antibiotics and disinfectants. Microorganisms 2026, 14(5), 988, doi: 10.3390/microorganisms14050988. IF=4,2, Q2.

  12.  Sveshnikova AN, Butenko IO, Davydova LA, Bersenev EYu, Gutnikov AV, Golomysova MM, Kitsilovskaya NA, Kovalenko AV, Kurilova OV, Lapina TA, Sello E, Tsarenko SV, Gorbunov KS. 7-day longitudinal proteomics of critically ill patients: a pilotstudy, Sci Rep, 2026,16: 25232, https://doi.org/10.1038/s41598-026-55106-7 . IF 3,9, Q1.

  13.  Eroshenko GA, Balykova AN, Konanov DN, Karapetyan LA, Kukleva LM, Naryshkina EA, Chervyakova NS, Krasnov YM, Shevchenko KS, Kutyrev VV. The role of the Caspian, Aral and Balkhash Lakes in the spread and preservation of Yersinia pestis in Eastern Europe and Central Asia in the 20th and 21st centuries. Pathogens. 2026; 15(6):568, doi: 10.3390/pathogens15060568. IF=3,8, Q1.

  14.  Malichava M, Lukashev A, Aleshina Y. Temporal dynamics of recombination in field isolates of foot-and-mouth disease virus. Viruses. 2026; 18(2):262, doi: 10.3390/v18020262. IF=3,8, Q1.

  15.  Nikiteev I, Kuzmina J, Rog I, Bugrova A, Gushchin I, Naberezhnov D, Shevelyova M, Maksimenko O, Zaynullin K, Fedorov O. Optimization of expression and thermostability of terminal deoxynucleotidyl transferase through iterative mutagenesis and computational design. Appl Biochem Biotechnol 2026, doi: 10.1007/s12010-025-05569-7. IF=3,3, Q2.

  16.  Konanov DN, Balykova AN, Vvedensky AV, Lukina-Gronskaya AV, Liubimova ON, Kovrizhnikov AV, Speranskaya AS, Krivonos DV, Eroshenko GA, Ilina EN, Govorun VM, Kutyrev VV. Temperature-dependent dynamics of DNA methylation and plasmid copy number in Yersinia pestis. BMC Genomics. 2026. Vol. 27: 571, doi: 10.1186/s12864-026-12915-4. IF=3,7, Q1.

  17.  Panina IS, Vlasova YuS, Panina YuS, Krasilnikov MS, Alferova VA, Korshun VA, Chugunov AO. Towards molecular dynamics simulation of membrane-targeting photosensitizing antivirals. PCCP (Physical Chemistry Chemical Physics) 2026, doi: 10.1039/D5CP04006J, IF=2,9, Q2. 

  18. Yagudaeva EY, Zybin DI, Sizova SV, Suetina IA, Mezentseva MV, Kapustin DV. The sorption effects of aniline-containing coatings in relation to biopolymers and supramolecular objects—viruses and human cells. Chem Pap. 2026,80, 10799–10817, doi: 10.1007/s11696-026-05045-4. IF=2,7, Q2.

  19. Perepelov AV, Kasimova AA, Filatov AV, Toukach PV, Babich TL, Popova NM, Krivonos DV, Safonov AV. Structure elucidation and gene cluster annotation of the O-antigen of Stutzerimonas chloritidismutans NP21570 with 2-acetamido-2-deoxy-D-mannuronic acid. Carbohydrate Research, 2026, 567: 109993, doi: 10.1016/j.carres.2026.109993. IF=2,5, Q2.

  20.  Lyamina S, Baranovskii D, Kalish S, Kozhevnikova E, Ivanova T, Kisel A, Koryakin S, Saburov V, Atiakshin D, Klabukov I, Govorun V. Effect of fractionated electronbeam irradiation on senescence development in human adipose tissue stromalcells. Curr Stem Cell Res Ther 2026, 21 (7): 587-598, doi: 10.2174/011574888X420460251201091226, IF=2,2, Q3.

  21.   Vorobeva AS, Kazakova EM, Garibova LA, Emekeeva DD, Kusainova TT, Fedorov II, Shelepchikov AA, Tretyakov AV, Chugunov AO, Gorshkov MV, Tarasova IA. Proteasome inhibition as a cancer type-specific off-target effect of everolimus in cancer cells. Biochemistry (Moscow) 91(2), 1–15, doi: 10.1134/S0006297925603284. IF=2,2, Q2.
    Воробьева А.С., Казакова Е.М., Гарибова Л.А., Емекеева Д.Д., Кусаинова Т.Т., Федоров И.И., Шелепчиков А.А., Третьяков А.В., Чугунов А.О., Горшков М.В., Тарасова И.А. Ингибирование протеасомы как побочный эффект эверолимуса, специфичный к типу рака. Биохимия. 2026. Т. 91. № 2. С. 322-338, doi: 10.7868/S3034529426020062.

  22.   Kordyukova LV, Serebryakova MV, Panina IS, Veit M. Differential S-acylation of viral and cellular proteins: Structural determinants,enzymes, and putative functional implications. Biochemistry (Moscow). 2026, 91: 1157–1173, doi: 10.1134/S0006297926601905. IF=2,1, Q4 (WoS), Q2 (Scopus).

  23.   Veretenenko II, Vantsev VV, Trofimov YA, Efremov RG, Ligand-mediated conformationalplasticity of the pore domain of TRPV6 ion channel. Russ J Bioorg Chem, 2026, 52: 72, 10.1134/S1068162026601643, IF 1,7, Q3.

  24.   Nolde DE, Kocharovskaya MV, Popov AV, Kirpichnikov MP, Lyukmanova EN, Shenkarev ZO. Point substitution N33D in the light chain of neutralizing antibody REGN10987 increases the FAB affinity to RBD of omicron BA.1 SARS-CoV-2 variant. In silico study. Russ J Bioorg Chem, 2026, 52(3): 1-22, doi: 10.1134/S1068162026600662. IF 1,7, Q3.
      Нольде Д.Е., Кочаровская М.В., Попов А.В., Кирпичников М.П., Люкманова Е.Н., Шенкарев З.О. Точечная замена N33D в легкой цепи FAB нейтрализующего антитела REGN10987 увеличивает аффинность и стабильность комплекса с RBD. Биоорганическая химия. 2026. Т. 52. № 3. С. 420-439, doi: 10.7868/S1998286026030061.

  25.   Kharrasov DR, Fisunov GYu, Matyushkina DS, Tsoy EA, Semenova EA, Kutukov RR, Rog IS, Sandanova DA, Borodina MM, Govorun VM. Cloning of Mycoplasma gallisepticum genome in Saccharomyces cerevisiae cells. Molecular Biology, 2026, Vol. 60, 36–48, doi: 10.1134/S0026893325604896. IF=1,2, Q3.
      Харрасов Д.Р., Фисунов Г.Ю., Матюшкина Д.С., Цой Е.А., Семёнова Е.А., Кутуков Р.Р., Рог И.С., Санданова Д.А., Бородина М.М., Говорун В.М. Клонирование генома Mycoplasma gallisepticum в клетках Saccharomyces cerevisiae. Молекулярная биология, 2026, том 60 (3): 474-485, doi: 10.7868/S3034555326010038.

  26.   Naberezhnov D, Lygun O, Kalinina T, Nikiteev I, Kuzmina J, Drozhzhina M, Kozhemyakin G, Baraboshkin N, Lebedeva A, Viryasova G, Fedorov O. Medium-throughput column DNA extraction using 24-well racks. J Vis Exp. 2026. 233: e70553, doi: 10.3791/70553. IF=1,2, Q3 (WoS), Q2 (Scopus).

  27.   Nechipurenko YD, Vasilenko EO, Ugriumov KA, Karnaukhov AV, Tumanyan VG. Allostericeffects upon binding of proteins and antibiotics on DNA; Hiistory and thepresent, Molecular Biology, 2026, Vol. 60, 36–48, 10.1134/S0026893325700554, IF=1,2, Q3.
      Нечипуренко Ю.Д., Василенко Е.О., Угрюмов К.А., Карнаухов А.В., Туманян В.Г. Аллостерический эффект при связывании белков и антибиотиков на днк: история и современность. Молекулярная биология. 2026. Т. 60. № 1. С. 44-59, doi: 10.7868/S3034555326010038

  28.   Abaimov DA, Fedorova TN, Shabalina AA, Silantyev AS, Konanov DN, Fedotova EY, Poleshchuk VV, Andreev MN, Trifonova OV, Maslov DL, Balashova EE, Sychev DA, Illarioshkin SN, Lokhov PG. The effect of levodopa on the blood antioxidant system and metabolome in patients with Parkinson's disease. Biomed Khim. 2026 May;72(2):141-151, doi: 10.18097/PBMCR1642. IF=0,83, Q4.

  29.   Молотковский Р.Ю., Кузьмин П.И., Башкиров П.В. Формирование липидных нанодоменов в асимметричных мембранах за счет упругого сопряжения их монослоев. Биологические мембраны. 2026. Т. 43. № 2. С. 101-113, doi: 10.7868/S3034521926020015, IF=0,747, Q4.

  30.   Берсенев Е.Ю., Лапина Т.А., Курилова О.В., Селло Е.О., Давыдова Л.А., Царенко С.В., Горбунов К.С. Неинвазивный мониторинг и прогностические индикаторы в критических состояниях: от гемодинамики до метаболизма (систематический обзор). Экстремальная биомедицина. 2026, doi: 10.47183/mes.2026-479. IF=0,719

2025

  1. Kudriaeva AA, Butenko IO, Saratov GA, Ri MТ, Mokrushina YA, Bondarev AA, Evpak AS, Smirnov IV, Matyushkina DS, Gabibov AG, Govorun VM, Belogurov Jr. AA. Mutational pressure promotes release of proteasome-generated public CD8+ T cell epitopes from SARS-CoV-2 RBD of Omicron and its current lineages, iScience. 2025, doi: 10.1016/j.isci.2025.111873. IF=4,6; Q1
  2. Lifanov D, Zorigt D, Shabalina E, Khalil A, Gorbunov K, Petersen E. Method for determining of cytotoxicity based on the release of fluorescent proteins. BMC Mol and Cell Biol. 2025, 26(7),  doi: 10.1186/s12860-025-00532-0. IF=2,4; Q1
  3. Sumarokova M, Pavlov R, Lavushchenko T, Vasilenko E, Kozhemyakin G, Fedorov O, Molotkovsky R, Bashkirov P. SARS-CoV-2 FP1 destabilizes lipid membranes and facilitates pore formation. Int J Mol Sci. 2025, 26(2), 686; doi: 0.3390/ijms26020686. IF=4,9; Q1
  4. Ledov VA, Romanenko VV, Golovina ME, Alkhazova BI, Kovalchuk AL, Aparin PG. A candidate Ac3-S-LPS vaccine against S. flexneri 1b, 2a, 3a, 6, and Y activates long-lived systemic and mucosal immune responses in healthy volunteers: Results of an open-label, randomized 2 clinical trial. Vaccines. 2025, 13, 209, doi: 10.3390/vaccines13030209. IF=5,2, Q1
  5. Panyushkina A, Matyushkina D, Pobeguts O, Muravyov M, Letarov A. Mechanisms of microbial hyper-resistance to heavy metals: Cellular metal accumulation, metabolic reorganization, and GroEL chaperonin in extremophilic bacterium Sulfobacillus thermotolerans in response to zinc. J Hazard Mater. 2025, 488:137490, doi: 10.1016/j.jhazmat.2025.137490. IF=12,2; Q1
  6. Krivonos DV, Fedorov DE, Klimina KM, Veselovsky VA, Kovalchuk SN, Pavlenko AV, Yanushevich OO, Andreev DN, Sokolov FS, Fomenko AK, Devkota MK, Andreev NG, Zaborovsky AV, Tsaregorodtsev SV, Evdokimov VV, Krikheli NI, Bely PA, Levchenko OV, Maev IV, Govorun VM, Ilina EN. Gut mycobiome changes during COVID-19 disease. J Fungi. 2025, 11, 194, doi: 10.3390/jof11030194. IF=4,2; Q1
  7. Popov N, Sonets I, Evdokimova A, Molchanova M, Panova V, Korneenko E, Manolov A, Ilina E. AliMarko: A pipeline for virus identification using an expert-guided approach. Viruses 2025, 17(3), doi: 10.3390/v17030355. IF=3,8; Q1
  8. Korneenko E, Rog I, Chudinov I, Lukina-Gronskaya A, Kozyreva A, Belyaletdinova I, Kuzmina J, Fedorov O, Evsyutina D, Matyushkina D, Govorun V, Speranskaya A. Antibiotic resistance and viral co-infection in children diagnosed with pneumonia caused by Mycoplasma pneumoniae admitted to Russian hospitals during October 2023—February 2024. BMC Infectious Diseases. 2025, 25(1): 363, doi: 10.1186/s12879-025-10712-0. IF=3,4, Q1
  9. Semashko TA, Fisunov GY, Shevelev GY, Govorun VM. BAC-browser: the tool for synthetic biology. BMC Bioinformatics 2025, 26, 27, doi: 10.1186/s12859-025-06049-9. IF=2,9; Q1
  10.  Krivonos D, Pavlenko A, Lukina-Gronskaya A, Korneenko E, Speranskaya A, Ilina E  Case Report: Fatal case of dual infection Metapneumovirus complicated by Streptococcus pyogenes Front Med 12:1576583 IF=3,1, Q1
  11.  Павленко А.В., Сонец И.В., Манолов А.И., Старикова Е.В., Ильина Е.Н.  Резистотипы как характеристика сообществ микроорганизмов, ассоциированных со здоровьем человека. Систематический обзор Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2025. 102(1): 112-126 IF=0,128, Q3
  12.  Krivonos DV, Fedorov DE, Konanov DN, Vvedensky AV, Sonets IV, Korneenko EV, Speranskaya AS, Ilina EN. Pike: OTU-Level Analysis for Oxford Nanopore Amplicon Metagenomics. Int J Mol Sci. 2025, 26(9), 4168 IF=4,9, Q1
  13.  Shokina VA, Maleeva AV, Volok VP, Shcherbakova OV, Postika NE, Melikhova AV, Mokhirev DY, Tikhonova AA, Engin D, Lukina-Gronskaya AV, Rog IS, Chudinov IK, Lazareva AA, Kovalenko AV, Kuzmina YE, Fedorov OV, Speranskaya AS, Kudriavtsev AV. Humoral and cellular immune response to the genetically detoxified S1 subunit of pertussis toxin in mice. Biochem. Moscow Suppl. Ser. A  2025, 19: 210–218, doi: 10.1134/S1990747825700163 IF=1,1
  14.  Aliper ET, Ryzhov IM, Obukhova PS, Tuzikov AB, Galanina OE, Ziganshina MM, Sukhikh GT, Krylov NA, Henry SM, Efremov RG, Bovin N.V. Immune antibodies recognizing the stem region of SARS-CoV-2 spike protein: molecular modelling and in vitro study of synthetic peptides presentation to the antibodies. Antibodies 2025, 644166  IF=3,0, Q1
  15.  Konanov DN, Tereshchuk VY, Sonets IV, Korneenko EV, Lukina-Gronskaya AV, Speranskaya AS, Ilina EN. Analysis of software read cross-contamination in DNBSEQ data. Biology. 2025; 14(6):670. doi: 10.3390/biology14060670 IF=3,6, Q1
  16.  Lohan S, Konshina AG, Mohammed EHM, Helmy NM, Jha SK, Tiwari RK, Maslennikov I, Efremov RG, Parang K. Impact of stereochemical replacement on activity and selectivity of membrane-active antibacterial and antifungal cyclic peptides. NPJ Antimicrob Resist 2025, 3, 56, doi: 10.1038/s44259-025-00121-3
  17.  Sinichich AA, Krivonos DV, Baranova AA, Zhitlov MY, Belozerova OA, Lushpa VA, Vvedensky AV, Serebryakova MV, Kalganova AI, Kudzhaev AM, Prokopenko YA, Sinelnikova SS, Trusova EA, Kovalchuk SI, Ilina EN, Terekhov SS, Alferova VA. Genome-guided metabolomic profiling of peptaibol-producing Trichoderma. Int J Mol Sci 2025, 26(12), 5599, doi: 10.3390/ijms26125599. IF=4,9, Q1
  18.  Chudinov IK, Speranskaya AS. Facilitating rapid screening of metaviral data with the VERA Pipeline. Маthematical Biology and Bioinformatics. 2025;20(1):100-121. doi: 10.17537/2025.20.100 IF=0,647, Q4
  19.  Zakharzhevskaya NB, Shagaleeva OYu, Kashatnikova DA, Goncharov AO, Evsyutina DV, Kardonsky DA, Vorobeva EA, Silantiev AS, Kazakova VD, Kolesnikova IV, Butenko IO, Vanyushkina AA, Smirnova SV, Chaplin AV, Efimov BA. Proteogenomic annotation of t6ss components identified in Bacteroides fragilis secretome. Front Microbiol. 2025, 16: 1495971, doi: 10.3389/fmicb.2025.1495971 IF=4, Q1
  20.   Baranovskii D, Lyamina S, Kisel A, Kalish S, Kozhevnikova E, Ivanova T, Isaeva E, Govorun V, Klabukov ID. Electron beam irradiation induces senescence alterations in human adipose-derived stem cells. Stem Cell Rev and Rep. 2025, 21(4): 1138-1140, doi: 10.1007/s12015-025-10867-y IF=4,2, Q2
  21.  Молотковский РЮ, Башкиров ПВ. Влияние кривизны мембраны на энергетический барьер порообразования. Биологические мембраны. 2025, 42(2): 117-129, doi: 10.31857/S0233475525020037 IF=1,1, Q4
  22.  Костина ДИ, Сумарокова МВ, Дудик СП, Башкиров ПВ, Акимов С.А. Линейное натяжение кромки поры в мембране на твердой подложке. Биологические мембраны. 2025, 42(2): 130-141, doi: 10.31857/S0233475525020049  IF=1,1, Q4
  23.  Бондаренко ЕВ, Бутенко ИО, Иоутси ВА, Кициловская НА, Аксенова ТН, Лазарева АА, Мокрышева НГ. Потенциальные маркеры новообразований щитовидной железы в восходящем протеомном анализе плазмы крови. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2025, 179(1): 90-94, doi: 10.47056/0365-9615-2025-179-1-90-94 IF=0,8, Q3
  24.  Molotkovsky RJ, Galimzyanov TR, Minkevich MM, Pinegin KV, Kuzmin PI, Bashkirov PV. Energy pathway of lipid monolayer fusion: From droplet contact to coalescence. J. Phys. Chem. B 2025, 129, 27, 7010–7021 10.1021/acs.jpcb.5c02054. IF=2,9, Q1
  25.  Zlobina VV, Mitkevich VA, BershatskyYV, Volynsky PE, Pavlov KV, Karbyshev MS, Okhrimenko IS, Kozin SA, Efremov RG,·Makarov AA,·Bocharov EV. Transient cholesterol interactions with the amyloid precursor protein involved in Alzheimer’s disease pathogenesis. Byophys Rev (2025). doi: 10.1007/s12551-025-01358-y. IF=3,7, Q1.
  26.  Kerr JA, Patton GS, Cini KI,… Vladimirov SK…, Gakodou E, Saywer SM, Azzopardi PS. Global, regional, and national prevalence of child and adolescent overweight and obesity, 1990–2021, with forecasts to 2050: a forecasting study for the Global Burden of Disease Study 2021. The Lancet. 2025, 405(10481): 785-812, doi: 10.1016/ S0140-6736(25)00397-6. IF=88,5, Q1
  27.  Perelygin FS, Lukashev AN, Aleshina YA. The effect of taxonomic, host-dependent features and sample bias on virus host prediction using machine learning and short sequence k-mers. Sci Rep. 2025 Aug 27;15(1):31592. doi: 10.1038/s41598-025-17123-w. IF=3,9, Q1
  28.  Ponomarev B, Ponomareva N, Kachanov A, Evmenov K, Brezgin S, Kostyusheva A, Chulanov V, Timashev P, Kostyushev D, Lukashev A. Overcoming antibiotic resistance and treating bacterial infections with biological nanoparticles. Int J Mol Sci 2025. Т. 26. № 24: 11780. doi: 10.3390/ijms262411780 IF=4,9, Q1.
  29.  Gulyaeva K, Nadinskaia M, Maslennikov R, Aleshina Y, Goptar I, Lukashev A, Poluektova E, Ivashkin V. Gut microbiota analysis in cirrhosis and non-cirrhotic portal hypertension suggests that portal hypertension can be main factor of cirrhosis-specific dysbiosis. Sci Rep. 2025 Mar 11;15(1):8394. doi: 10.1038/s41598-025-92618-0. IF=3,9, Q1
  30.  Гарагуля ДА, Евсютина ДВ, Рог ИС, Фисунов ГЮ. Коррекция ошибок, возникающих  при синтезе фрагментов ДНК, с использованием эндонуклеазы V из Thermoogata maritima. Генетика 2025, 61(8), doi: 10.31857/S0016675825080012, IF=0,6, Q4
  31.  Neuberger A, Shalygin A, Veretenenko II, Trofimov YuA, Gudermann Th, Chubanov V, Efremov RG, Sobolevsky AI. The locking mechanism of human TRPV6 inhibition by intracellular magnesium. Nat Commun 2025, 16: 2826, doi: 10.1038/s41467-025-65919-1, IF=15,7, Q1
  32.  Попова А.Ю., Аюпова А.Ф., Говорун В.М., Горбачёва А.А., Ильина Е.Н., Качалов В.Н., Козлов И.Е., Клочков К.А., Кутырев В.В., Лукашев А.Н., Манолов А.И., Маслова И.И., Самойлов А.Е., Сафронов В.А., Цуркис В.И. ПОЭМА: ПОпуляционная Эпидемиологическая Модель Агентная для прогноза эффективности противоэпидемических мероприятий в Российской Федерации. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2025, 102(5): 515-529. doi: 10.36233/0372-9311-760. IF=1,693, Q3
  33.  Konanov DN, Krivonos DV, Babenko VV, Ilina EN. Snappy: fast identification of DNA methylation motifs based on oxford nanopore reads. Bioinformatics Advances, 2025, 5(1): vbaf296. doi: 10.1093/bioadv/vbaf296. IF=2,8, Q1
  34.  Konanov DN, Liubimova ON, Kovrizhnikov AV, Sonets IV, Balykova AN,, Lukina-Gronskaya AV, Speranskaya AS, Krivonos DV, Eroshenko GA,, Ilina EN, Govorun VM, Kutyrev VV. Systematic analysis of spontaneous tandem genome amplification events in Yersinia pestis. PLOS ONE 2025, 20(12): e0338460. doi: 10.1371/journal.pone.0338460. IF=2,6, Q1
  35.  Vvedenskii AV, Ivkina AS, Konanov DN, Savinova TA, Fedorova LS, Ilina EN. Genetic determinants associated with the biofilm formation impairment in Pseudomonas aeruginosa clinical isolates. MicrobiologyOpen 2025, 14: 1–12. doi: 10.1002/mbo3.70168. IF=4,6, Q1
  36.  Матюшкина Д.С., Горбунов К.С., Фисунов Г.Ю., Говорун В.М. Синтетическая биология: мораль и разум. Генетика 2025, 61(11): 85-93, doi: 10.7868/S3034510325110093. IF=0,6, Q4. 
  37.  Sonets IV, Galeeva IS, Krivonos DV, Pavlenko AV, Vvedenskiy AV, Ahmetzyanova AA, Mikaelyan KA, Ilina EN, Yanushevich OO, Revazova ZE, Vibornaya EI, Runova GS, Aliamovskii VV, Bobr IS, Tsargasova MO, Kalinnikova EI, Govorun VM. In-depth multi-approach analysis of WGS metagenomics data reveals signatures potentially explaining features in periodontitis stage severity.  Dent J (Basel) 2025 Dec 8;13(12):590.  doi: 10.3390/dj13120590. IF=2,6, Q1.
  38.  Федорова Л.С., Ильякова А.В., Ивкина А.С., Дудик С.П., Ильина Е.Н. Метод формирования статической биопленки на поверхностях для оценки эффективности дезинфицирующих средств. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии  2025, 102(6): 773-782, doi: 10.36233/0372-9311-761. IF=1,693, Q3.
  39.  Aliper ET, Efremov RG. The coronavirus spike HR2 domain: An obscure player entering the limelight during membrane fusion? Biochim Biophys Acta Biomembr, 2025 Dec;1867(8):184445, doi: 10.1016/j.bbamem.2025.184445. IF=8,4, Q1.
  40.  Kim D-H, Hong MT, Bocharov EV, Park S, Bershatsky YaV, Volynsky PE, Kim E, Efremov RG, Cho W, Park S-Y, Ryu SH. EGFR activation requires cholesterol interaction at the inner leaflet of the plasma membrane. Sci Adv. 11(51): eadx2398б doi: 10.1126/sciadv.adx2398. IF=12,5, Q1.
  41.  Molotkovsky RJ, Denieva ZG, Senchikhin IN, Urodkova EK, Konarev PV, Peters GS, Galimzyanov TR, Pavlov RV, Bashkirov PV. Quantifying the activation barrier for phospholipid monolayer fusion governing lipid droplet coalescence. Int J Mol Sci 2025. Т. 26. № 23, 11664, doi: 10.3390/ijms262311664. IF=4,9, Q1.
  42.   Shulepko MA, Che Y, Paramonov AS, Kocharovskaya MV, Kulbatskii DS, Ivanova AA, Chugunov AO, Bychkov ML, Kirichenko AV, Shenkarev ZO, Kirpichnikov MP, Lyukmanova EN. Pro-inflammatory protein PSCA is upregulated in neurological diseases and targets β2-subunit-containing nAChRs. Biomolecules  2025, 15 (10), 1381, doi: 10.3390/biom15101381. IF=4,8, Q1.
  43.  Vasilenko EO, Ivankov DN. Deriving kinetic parameters of amyloid aggregation from concentration dependence of lag phase. European Physical Journal Plus, 2025, Vol 140 (12): 1251, doi: 10.1140/epjp/s13360-025-07180-5. IF=2,9, Q2.
  44.   Maryewski XA, Krasilnikov MS, Straková P, Holoubek J, Frčková T, Panina IS, Krylov NA, Gvozdev DA, Denisov VS, Semenov AN, Lotosh NY, Selishcheva AA, Chistov AA, Gulyak EL, Kozhemyakin GL, Korshun VA, Efremov RG, Ustinov AV, Růžek D, Eyer L, Alferova VA. Membrane-activesinglet oxygen photogenerators as a paradigm for broad-spectrum antivirals: Thecase of halogenated (BOron)-DIPYrromethenes. ACS Appl. Mater. Interfaces. 2025. 17(3): 4502–4528, doi: 10.1021/acsami.4c17482. IF=7,8, Q1.
  45.   Kuzmichenko P, Fedorov D, Galeeva J, Postoeva A, Krieger E, Kudryavtsev A, Pavlenko A, Vvedensky A, Starikova E, Govorun V, Ilina E. Comparing alignment and de-novo approaches for gut microbiota metagenomic data analysis reveals differences in taxonomic resolution and novel functional insights. Sci Rep 2025, 15:42423, doi: 10.1038/s41598-025-26617-6. IF=3,9, Q1.


2024

Shender VO, Anufrieva KS, Shnaider PV, Arapidi G, Pavlyukov M, Ivanova O, Malyants I, Stepanov G, Zhuravlev E, Ziganshin R, Butenko I, Bukato O, Klimina K, Veselovsky V, Grigoryeva T, Malanin S, Aleshikova O, Slonov A, Babaeva N, Ashrafyan L, Khomyakova E, Evtushenko E, Lukina M, Zixiang Wang, Silantiev A, Nushtaeva A, Kharlampieva D, Lazarev V, Lashkin A, Arzumanyan, Petrushanko I, Makarov A, Lebedeva O, Bogomazova A, Lagarkova M, Govorun V. Therapy-induced secretion of spliceosomal components mediates pro-survival crosstalk between ovarian cancer cells. Nat Commun 15, 5237 (2024). doi: 10.1038/s41467-024-49512-6. ИФ=14,7

Molodtsov V, Wang C, Zhang J, Kaelber JT, Blaha G, Ebright RH. Structural basis of RfaH-mediated transcription–translation coupling. Nat Struct Mol Biol 2024, 31, 1932–1941, doi: 10.1038/s41594-024-01372-w. ИФ=12,5

Vakhrusheva AV, Romanovskaya-Romanko EA, Stukova MA, Sukhova MM, Kuznetsova KS, Kudriavtsev AV, Frolova ME, Ivanishin TV, Krasilnikov IV, Isaev AA. Comparative analysis of the neutralizing capacity of monovalent and bivalent formulations of Betuvax-CoV-2, a subunit recombinant COVID-19 vaccine, against various strains of SARS-CoV-2. Vaccines (Basel). 2024, 12(10):1200, doi: 10.3390/vaccines12101200. ИФ=5,2

Ebrahim N, Kondratyev N, Artyuhov A, Timofeev A, Gurskaya N, Andrianov A, Izrailov R, Volchkov E, Dyuzheva T, Kopantseva E, Kiseleva E, Golimbet V, Dashinimaev E. Human pancreatic islet-derived stromal cells reveal combined features of mesenchymal stromal cells and pancreatic stellate cells. Stem Cell Res Ther. 2024, 15(1):351. doi: 10.1186/s13287-024-03963-2. ИФ=7,1

Shagaleeva OYu, Kashatnikova DA, KardonskyDA, Danilova EYu, Ivanov VA, Evsiev SS, Zubkov EA, AbramovaOV, Zorkina YaA, Morozova AY, Konanov DN, Silantiev AS, Efimov BA, Kolesnikova IV, Bespyatykh YuA, Stimpson J, Zakharzhevskaya NB. GC-MS with headspace extraction for non-invasive diagnostics of IBD dynamics in a model of DSS-induced colitis in rats. Int J Mol Sci. 2024, 25(6): 3295; doi: 10.3390/ijms25063295. ИФ=4,9

Serebrennikova M, Grafskaia E, Maltsev D, Ivanova K, Bashkirov P, Kornilov F, Volynsky P, Efremov R, Bocharov E, Lazarev V. TriplEP-CPP: Algorithm for predicting the properties of peptide sequences. Int J Mol Sci. 2024, 25(13):6869. doi: 10.3390/ijms25136869. ИФ=4,9

Pavlov RV, Akimov SA, Dashinimaev EB, Bashkirov PV. Boosting lipofection efficiency through enhanced membrane fusion mechanisms. Int J Mol Sci. 2024, 25, 13540. https://doi.org/10.3390/ijms252413540. ИФ=4,9

Lukina-Gronskaya AV, Chudinov IK, Korneenko EV, Mashkova SD, Semashko TA, Sinkova MA , Penkin LA, Litvinova EM, Feoktistova NYu, Speranskaya AS. Novel coronaviruses and mammarenaviruses of hedgehogs from Russia including the comparison of viral communities of hibernating and active specimens. Fronti Vet Sci. 2024,11, 1486635, doi: 10.3389/fvets.2024.1486635. ИФ=4,8

Starikova EV, Galeeva YuS, Fedorov DE, Korneenko EV, Speranskaya AS, Selezneva OV, Zoruk PY, Klimina KM, Veselovsky VA, Morozov MD, Boldyreva DI, Olekhnovich EI, Manolov AI, Pavlenko AV, Kozlov IE, Yanushevich OO, Krikheli NI, Levchenko OV, Andreev DN, Sokolov FS, Fomenko AK, Devkota MK, Andreev NG, Zaborovsky AV, Tsaregorodtsev SV, Evdokimov VV, Bely PA, Maev IV, Govorun VM, Ilina EN. Oropharyngeal resistome remains stable during COVID-19 therapy, while fecal resistome shifts toward a less diverse resistotype. iScience. 27(12): 111319, doi: 10.1016/j.isci.2024.111319. ИФ=4,6

Arapidi GP, Urban AS, Osetrova MS, Shender VO, Butenko IO, Bukato ON, Kuznetsov AA, Saveleva TM, Nos GA, Ivanova OM, Lopukhov LV, Laikov AV, Sharova NI, Nikonova MF, Mitin AN, Martinov AI, Grigorieva TV, Ilina EN, Ivanov VT, Govorun VM. Non-human peptides revealed in blood reflect the composition of intestinal microbiota. BMC Biology 2024, 22(1), 178, doi: 10.1186/s12915-024-01975-1. ИФ=4,4

Larin AK, Klimina KM, Veselovsky VA, Olekhnovich EI, Morozov MD, Boldyreva DI, Yunes RA, Manolov AI, Fedorov DE, Pavlenko AV, Galeeva YS, Starikova EV, Ilina EN. An improved and extended dual-index multiplexed 16S rRNA sequencing for the Illumina HiSeq and MiSeq platform. BMC Genom Data 2024, 25(1): 8, doi: 10.1186/s12863-024-01192-3. ИФ=4,4

Fisunov GY, Tsvetkov VB, Tsoy EA, Evsyutina DV, Vedyaykin AD, Garanina IA, Semashko TA, Manuvera VA, Varizhuk AM, Kovalchuk SI, Zubov AI, Barinov NA, Pobeguts OV, Govorun VM. WhiA transcription factor provides feedback loop between translation and energy production in a genome-reduced bacterium. Front Microbiol. 2024, 15, doi: 10.3389/fmicb.2024.1504418. ИФ=4,0

Galeeva JS, Fedorov DE, Starikova EV, Manolov AI, Pavlenko AV, Selezneva OV, Klimina KM, Veselovsky VA, Morozov MD, Yanushevich OO, Krikheli NI, Levchenko OV, Andreev NA, Sokolov FS, Fomenko AK, Devkota MK, Andreev NG, Zaborovskiy AV, Bely PA, Tsaregorodtsev SV, Evdokimov VV, Maev IV, Govorun VM, Ilina EN. Microbial signatures in COVID-19: Distinguishing mild and severe disease via gut microbiota. Biomedicines 2024, 12(5), 996; doi: 10.3390/biomedicines12050996. (This article belongs to the Special Issue Gut Microbiota, Diet, and Immunity: Investigating the Connections and Implications for Disease Development). ИФ=3,9

Speranskaya AS, Dorokhin AV, Korneenko EV, Chudinov IK, Samoilov AE, Kruskop SV. A novel mastadenovirus from N. noctula which represents a distinct evolutionary branch of viruses infecting bats in Europe. Viruses 2024, 16(8), 1207; doi: 10.3390/v16081207. ИФ=3,8

Ivanova OE, Eremeeva TP, Morozova NS, Mikhailova YuM, Kozlovskaya LI, Baikova OY, Shakaryan AK, Krasota AY, Korotkova EA, Yakovchuk EV, Shustova EY, Lukashev AN. Non-Polio enteroviruses isolated by acute flaccid paralysis surveillance laboratories in the Russian Federation in 1998-2021: Distinct epidemiological features of types. Viruses. 2024, 16(1): 135, doi: 10.3390/v16010135. ИФ=3,8

Yakovlev, AS, Afanasev VV, Alekseenko SI, Belyaletdinova IK, Isankina LN, Gryaznova IA, Skalny AV, Kozlovskaya LI, Ishmukhametov AA, Karganova GG. Prevalence and clinical impact of viral and bacterial coinfections in hospitalized children and adolescents aged under 18 years with COVID-19 during the omicron wave in Russia. Viruses 2024, 16, 1180, doi: 10.3390/v16081180. ИФ=3,8

Reznikova D, Kochetkov N, Vatlin A, Nikiforov-Nikishin D, Galanova O, Klimuk A, Smorodinskaya S, Matyushkina D, Kovalenko A, Butenko I, Marsova M, Danilenko V. Levilactobacillus brevis 47f: Bioadaptation to low doses of xenobiotics in aquaculture. Biology. 2024, 13(11): 925, doi: 10.3390/biology13110925. ИФ=3,6

Korneenko EV, Samoilov AE, Chudinov IK, Butenko IO, Sonets IV, Artyushin IV, Yusefovich AP, Kruskop SV, Sinitsyn SO, Klyuchnikova EO, Gladkikh AS, Dedkov VG, Safonova MV, Daszak P, Speranskaya AS. Alphacoronaviruses from bats captured in European Russia in 2015 and 2021 are closely related to those of Northern Europe. Front Ecol Evol. 2024, Vol. 12, doi: 10.3389/fevo.2024.1324605. ИФ=2,4

Semashko TA, Fisunov GY, Tsoy EA, Kharrasov DR, Chudinov IK, Evsyutina DV, Shevelev GY, Govorun VM. Modern approaches to de novo synthesis of extended DNA fragments: Assembly of a wide repertoire of sequences. Acta Naturae. 2024, 16(1):77-85. doi: 10.32607/actanaturae.27362. ИФ=2,0

Фисунов ГЮ, Семашко ТА, Евсютина ДВ, Цой ЕА, Харрасов ДР, Гумаюнова КС, Тучков ИВ, Никифоров КА, Рыбальченко ДА, Кутырев ВВ, Говорун ВМ. Синтез генома бактериофага N4. Проблемы особо опасных инфекций. 2024; (1): 182-191. doi.org/10.21055/0370-1069-2024-1-182-191. ИФ=1,8

Kovalchuk SN, Arkhipova AL, Bondar SV, Konanov DN, Krivonos DV, Chulkova PS, .Ageevets VA, Fedorova LS, Ilina EN. A TaqMan real-time PCR assay for detection of qacEΔ1 gene in Gram-negative bacteria. J Microbiol Methods. 2024, 227:107054, doi: 0.1016/j.mimet.2024. ИФ=1,7

Павленко АВ, Манолов АИ, Есин ЮИ, Архипова АЛ, Введенский АВ, Кудрявцев АВ, Кригер ЕА, Шагров ЛЛ, Белова НИ, Ильина ЕН. Временная динамика резистома микробиоты кишечника здоровой популяции на фоне COVID-19. Антибиотики и химиотерапия. 2024, 69(8): 17–24, doi: 10.37489/0235-2990-2024-69-7-8-17-24. ИФ=0,8

Полякова ВИ, Кривонос ДВ, Климина КМ, Веселовский ВА, Орлов АВ, Федоров ДЕ, Корнеенко ЕВ, Пенкин ЛН, Павленко АВ, Ильина ЕН, Аршба ИМ. Возрастные особенности композиции микробиоты кишечника макак резусов, содержащихся в условиях неволи. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2024; 42(3): 22‑28. doi: 10.17116/molgen20244203122. ИФ=0,4

Ковальчук СН, Архипова АЛ, Ковылкова СЮ, Ильина ЕН, Федорова ЛС. Мультиплексная ПЦР в режиме реального времени для выявления генов qacA/B и smr у грамположительных бактерий. ЖМЭИ. 2024; 101(5): 692-698. doi: 10.36233/0372-9311-574. ИФ=0,128

Маслова ИИ, Манолов АИ, Глущенко ОЕ, Козлов ИЕ, Цуркис ВИ, Попов НС, Самойлов АЕ, Лукашев АН, Ильина ЕН. Ограничения в создании искусственных популяций в агентном моделировании эпидемий: систематический обзор. ЖМЭИ. 2024, 101(4): 530-545. doi: 10.36233/0372-9311-467. ИФ=0,128

Molotkovsky RJ, Bashkirov PV. Influence of membrane curvature on the energy barrier of pore formation. Biochem. Moscow Suppl. Ser. A 18 (Suppl 1), S1–S11 (2024). doi: 10.1134/S1990747825700011

Янушевич ОО, Крихели НИ, Маев ИВ, Заборовский АВ, Левченко ОВ, Галеева ЮС, Старикова ЕВ, Андреев ДН, Белый ПА, Соколов ФС, Фоменко АК, Царегородцев СВ, Андреев НГ, Евдокимов ВВ, Девкота МК, Кебина АЛ, Ильина ЕН, Говорун ВМ, Руднева ОВ. Оценка динамики патогенной микробиоты полости рта у пациентов с COVID-19 методом геномного секвенирования после применения пенки, обладающей антимикробным действием. Медицинский алфавит. 2024; (11): 7-13. doi: 10.33667/2078-5631-2024-11-7-13.

Лёдов ВА, Головина МА, Алхазова БИ, Анкудинов ИВ, Стряхнин ПА, Ковальчук АЛ, Апарин ПГ. Кандидатная вакцина на основе модифицированных липополисахаридов Shigella flexneri 1b, 2a, 3a, 6 и Y безопасна и стимулирует секрецию специфических антител у добровольцев, результаты 1 фазы клинических исследований. Бактериология. 2024; 9(4): 49-55, doi: 10.20953/2500-1027-2024-4-49-55.

Bryazka D, … Vladimirov SK, .Vollset SE et al. Forecasting the effects of smoking prevalence scenarios on years of life lost and life expectancy from 2022 to 2050: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2021. The Lancet Public Health. 2024; 9(10): e729-e744.

Naghavi M, ….Vladimirov SK, et al. Global burden of 288 causes of death and life expectancy decomposition in 204 countries and territories and 811 subnational locations, 1990–2021: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2021. The Lancet. 2024. Т. 403. № 10440. С. 2100-2132. ИФ=98

Vollset S., ….Vladimirov SK, et al. Burden of disease scenarios for 204 countries and territories, 2022–2050: a forecasting analysis for the Global Burden of Disease Study 2021, The Lancet. 2024. Т. 403. № 10440. С. 2204-2256. ИФ=98


2023

Konanov DN, Babenko VV, Belova AM, Madan AG, Boldyreva DI, Glushenko OE, Butenko IO, Fedorov DE, Manolov AI, Krivonos DV, Lazarev VN, Govorun VM, Ilina EN. Snapper: high-sensitive detection of methylation motifs based on Oxford Nanopore reads. Bioinformatics 2023, 39(11): btad702, doi:10.1093/bioinformatics/btad702

Galeeva JS, Starikov EV, Fedorov DE, Manolov AI, Pavlenko AV, Konanov DN, Krivonos DV, Babenko VV, Klimina KM, Veselovsky VA, Morozov MD, Gafurov IR, Gaifullina RF, Govorun VM, Ilina EN. Microbial communities of the upper respiratory tract in mild and severe COVID-19 patients: a possible link with the disease course. Front Microbiomes 2023, 2 doi: 10.3389/frmbi.2023.1067019

Krivonos DV, Konanov DN, Ilina EN. FunFun: ITS-based functional annotator of fungal communities. Ecol Evol. 2023,13(3):e9874.  doi: 10.1002/ece3.9874.

Lyamina S, Baranovskii D, Kozhevnikova E, Ivanova T, Kalish S, Sadekov T, Klabukov I, Maev I, Govorun V. Mesenchymal stromal cells as a driver of inflammaging. Int J Mol Sci 2023, 24, 6372. doi.org/10.3390/ijms24076372 

Shakurov R, Sizova S, Dudik S, Serkina A, Bazhutov M, Stanaityte V, Tulyagin P, Konopsky V, Alieva E, Sekatskii S, Bespyatykh J, Basmanov D. Dendrimer-based coatings on a photonic crystal surface for ultra-sensitive small molecule detection. Polymers 2023; 15(12): 2607. doi: 10.3390/polym15122607

Speranskaya AS, Artyushin IV, Samoilov AE, Korneenko EV, Khabudaev K, Ilina EN, Yusefovich AP, Safonova MV, Dolgova AS, Gladkikh AS, Dedkov VG, Daszak P. Identification and genetic characterization of MERS-related coronavirus isolated from Nathusius pipistrelle (Pipistrellus nathusii) near Zvenigorod (Moscow region, Russia), Int J Environmental Res & Public Health 2023. 20(4), 3702. doi: /10.3390/ijerph20043702

Kuznetsova SS, Speranskaya AS, Lisenkova AA, Kruskop SV. The complete mitochondrial genome of Glischropus bucephalus (Vespertilionidae; Chiroptera) provides new evidence for Pipistrellus paraphyly. Diversity 2023, 15, 1085. doi: 10.3390/d15101085

Korolkova Yu, Mikov A, Lobas A, Solovyeva E, Surin A, Andreev Ya, Gorshkov M, Kozlov S. Venom-gland transcriptomics and venom proteomics of the Tibellus oblongus spider. Sci Data  2023, 10(820), doi: 10.1038/s41597-023-02703-0. 

Aftahy K, Arrasate P, Bashkirov PV, Kuzmin PI, Maurizot V, Huc I*, Frolov VA* Molecular sensing and manipulation of protein oligomerization in membrane nanotubes with bolaamphiphilic foldamers. J Am Chem Soc 2023, 145, 46, 25150–25159, doi: 10.1021/jacs.3c05753.

Tsavkelova EA, Churikovа OA, Volynchikova EA, Sapun SS,·Leontieva MR, Speranskaya AS, Konorov EA,·Krinitsina AA. Plant‑associated bacteria of Syringa vulgaris L. in an urban environment. Plant Soil 2023, doi: 10.1007/s11104-023-06417-5  Аннотацию статьи см. здесь. 

Bondareva M, Budzinski L, Durek P, Witkowski M, Angermair S, Ninnemann J, Kreye J, Letz P, Ferreira-Gomes M, Semin I, Guerra GM, Momsen Reincke S, Sánchez-Sendin E, Yilmaz S, Sempert T, Heinz GA, Tizian C, Raftery M, Schönrich G, Matyushkina D, Smirnov IV, Govorun VM, Schrezenmeier E, Stefanski AL, Dörner T, Zocche S, Viviano E, Klement N, Sehmsdorf KJ, Lunin A, Chang HD, Drutskaya M, Kozlovskaya L, Treskatsch S, Radbruch A, Diefenbach A, Prüss H, Enghard P, Mashreghi MF, Kruglov AA. Cross-regulation of antibody responses against the SARS-CoV-2 Spike protein and commensal microbiota via molecular mimicry. Cell Host Microbe. 2023, 31:1866-1881. doi: 10.1016/j.chom.2023.10.007.

Brezgin S, Parodi A, Kostyusheva A, Ponomareva N, Lukashev A, Sokolova D, Pokrovsky VS, Slatinskaya O, Maksimov G, Zamyatnin AA Jr, Chulanov V, Kostyushev D. Technological aspects of manufacturing and analytical control of biological nanoparticles. Biotechnol Adv. 2023, 64:108122. doi: 10.1016/j.biotechadv.2023.108122.

Kostyushev D, Kostyusheva A, Brezgin S, Ponomareva N, Zakirova NF, Egorshina A, Yanvarev DV, Bayurova E, Sudina A, Goptar I, Nikiforova A, Dunaeva E, Lisitsa T, Abramov I, Frolova A, Lukashev A, Gordeychuk I, Zamyatnin AA Jr, Ivanov A, Chulanov V. Depleting hepatitis B virus relaxed circular DNA is necessary for resolution of infection by CRISPR-Cas9. Mol Ther Nucleic Acids. 2023 31:482-493. doi: 10.1016/j.omtn.2023.02.001.

Vakulenko YA, Orlov AV, Lukashev AN. Patterns  and temporal dynamics of natural recombination in Noroviruses. Viruses. 2023 15(2):372. doi: 10.3390/v15020372.

Шокина ВА, Матюшкина ДС, Кривонос ДВ, Манувера ВА, Широков ДА, Харлампиева ДД, Лазарев ВН, Павленко АВ, Ильина ЕН, Румянцев АГ, Румянцев СА, Иванов КП, Хромова ПА, Баклаушев ВП, Корицкий АВ, Куропаткин ВА, Москалева ЕВ, Огарков ОБ, Орлова ЕА, Петрова АГ, Поженько НС, Пушкарь ДЮ, Колонтарев КБ, Колышкина НА, Рычкова ЛВ, Самойлов АС, Синьков ВВ, Соловьева СВ, Троицкий АВ, Удалов ЮД, Юсубалиева ГМ, Говорун ВМ. Гуморальный иммунный ответ на линейные и конформационные эпитопы SARS-CoV-2 у пациентов с COVID-19. Иммунология 2023, 44 (1): 38-52. doi: 10.33029/0206-4952-2023-44-1-38-52

Маев ИВ, Левченко АИ, Галеева ЮС, Андреев ДН, Осипенко ЮВ, Бордин ДС, Ильина ЕН. Сравнительный анализ кишечной микробиоты у больных с экзокринной недостаточностью поджелудочной железы различной степени тяжести. Тер. архив 2023, 95 (2): 130-139. https://omnidoctor.ru/upload/iblock/416/4mddjbtm91wft2js4lfwduh6feoid0jp.pdf

Белялетдинова ИХ, Сайфуллин МА, Гусева ГД, Перекопская НЕ. Мультисистемный воспалительный синдром, ассоциированный с коронавирусной инфекцией COVID-19, у взрослого пациента: клиническое наблюдение. Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение 2023, 12 (1): 123-127. doi.org/10.33029/2305-3496-2023-12-1-123-127 

Ковальчук СН, Федорова ЛС, Ильина ЕН. Молекулярные механизмы микробной устойчивости к дезинфицирующим средствам. Антибиотики и химиотерапия 2023, 68 (1-2): 45-56. doi: 10.37489/0235-2990-2023-68-1-2-45-56.

Литвинова ММ, Хафизов КФ, Сперанская АС, Мацвай АД, Асанов АЮ, Никольская КА, Винокурова ЛВ, Дубцова ЕА, Ипатова МГ, Мухина ТФ, Карнаушкина МА, Бордин ДС. Спектр вариантов генов PRSS1, SPINK1, CTRC, CFTR и CPA1 у пациентов с хроническим панкреатитом в России. Современные технологии в медицине. 2023, 15 (2): 60. doi: 10.17691/stm2023.15.2.06

Грицышин ВА, Лисенкова АА, Сперанская АС, Артюшин ИВ, Шефтель БИ, Лебедев ВС, Банникова АА. Мультилокусный анализ филогенетических отношений в видовом комплексе Crocidura suaveolens sensu lato: сравнение с митохондриальными данными. Доклады Российской академии наук. Науки о жизни 2023, 509 (1): 147-154. doi: 10.31857/S2686738922600820.

Герасимов ВН, Харсеева ГГ, Гайтрафимова АР, Быстрова ЕВ, Федорова ЛС.  Антимикробные свойства кислородактивных дезинфектантов (обзор литературы). Эпидемиология и инфекционные болезни. 2023; 28(1): 35–43. doi: 10.37489/0235-2990-2023-68-1-2-45-56.

Шакарян АК, Белялетдинова ИХ, Шахгильдян СВ, Иванова ОЕ, Еремеева ТП, Гмыль АП, Байкова ОЮ, Мустафина ОН-И, Козловская ЛИ. Клинико-эпидемиологическая характеристика зарегистрированных в Российской Федерации в 2015–2019 гг. случаев острого вялого миелита у детей. Нервно-мышечные болезни. 2023, 13(3): 10-17, doi: 10.17650/2222‑8721‑2023‑13‑3‑10‑17.

2022

Semashko TA, Arzamasov AA, Evsyutina DV, Garanina IA, Matyushkina DS, Ladygina VG, Pobeguts OV, Fisunov GY, Govorun VM. Role of DNA modifications in Mycoplasma gallisepticum. PLoS One. 2022 Nov 22;17(11):e0277819. doi: 10.1371/journal.pone.0277819 .

Evsyutina DV, Semashko TA, Galyamina MA, Kovalchuk SI, Ziganshin RH, Ladygina VG, Fisunov GY, Pobeguts OV. Molecular basis of the slow growth of Mycoplasma hominis on different energy sources. Front Cell Infect Microbiol. 2022, doi: 10.3389/fcimb.2022.918557 

Jovanović O, Chekashkina K, Škulj S, Žuna K, Vazdar M, Bashkirov PV, Pohl EE. Membrane lipid reshaping underlies oxidative stress sensing by the mitochondrial proteins UCP1 and ANT1. Antioxidants 2022, 11 (12), 2314; doi: 10.3390/antiox11122314

Evsyutina DV, Fisunov GY, Pobeguts OV, Kovalchuk SI, Govorun VM. Gene Silencing through CRISPR Interference in Mycoplasmas. Microorganisms 2022, 10(6), 1159; doi: 10.3390/microorganisms10061159
Подробнее читайте здесь

Matyushkina D, Shokina V, Tikhonova P, Manuvera V, Shirokov D, Kharlampieva D, Lazarev V,  Varizhuk A, Vedekhina T, Pavlenko A, Penkin L, Arapidi G, Pavlov K, Pushkar D, Kolontarev K, Rumyantsev A, Rumyantsev S, Rychkova L, Govorun V.  Autoimmune effect of antibodies against the SARS-CoV-2 nucleoprotein. Viruses 2022, 14, 1141. doi: org/10.3390/v14061141 
Подробнее читайте здесь

Svetlova J, Gustin D, Manuvera V, Shirokov D, Shokina V, Prusakov K, Aldarov K, Kharlampieva D, Matyushkina D, Bespyatykh J, Varizhuk A, Lazarev V, Vedekhina T. Microarray profiling of vaccination-induced antibody responses to SARS-CoV-2 variants of interest and concern. Int J Mol Sci. 2022 Oct 30;23(21):13220. doi: 10.3390/ijms232113220.

Morozkin ES, Makenov MT, Zhurenkova OB, Kholodilov IS, Belova OA, Radyuk EV, Fyodorova MV, Grigoreva YE, Litov AG, Valdokhina AV, Bulanenko VP, Samoilov AE, Korneenko EV, Voizekhovskaya YA, Neverov AD, Karganova GG, Karan LS. Integrated jingmenvirus polymerase gene in Ixodes ricinus genome. 2022. Viruses 14(9): 1908

Ivanova, K.A., Bashkirov, P.V. Noise in ultrashort elastic membrane nanotube. Biochem. Moscow Suppl. Ser. A 2022, 16, 320–327. https://doi.org/10.1134/S1990747822050063

Корнеенко EВ, Самойлов АE, Артюшин ИВ, Юзефович АП, Долотова СМ, Ключникова ЕО, Сбарцалья ВА, Гладких АС, Дедков ВГ, Сперанская АС. «Альфакоронавирусы, выявленные в образцах фекалий летучих мышах, пойманных на территории Москвы и Ростова-на-Дону в 2021 году», Медицинский академический журнал том 22, № 2, 2022.  doi: 10.17816/MAJ108718

Акимкин ВГ, Попова АЮ, Хафизов КФ, Дубоделов ДВ, Углева СВ, Семененко ТА, Плоскирева АА, Горелов АВ, Пшеничная НЮ, Ежлова ЕБ, Летюшев АН, Демина ЮВ, Кутырев ВВ, Максютов РА, Говорун ВМ, Дятлов ИА, Тотолян АА, Куличенко АН, Балахонов СВ, Рудаков НВ, Троценко ОЕ, Носков АК, Зайцева НН, Топорков АВ, Лиознов ДА, Андреева ЕЕ, Микаилова ОМ, Комаров АГ, Ананьев ВЮ, Молдованов ВВ, Логунов ДЮ, Гущин ВА, Дедков ВГ, Черкашина АС, Кузин СН, Тиванова ЕВ, Кондрашева ЛН, Саенко ВВ, Селезов СЮ, Гасанов ГА, Сванадзе НХ, Глазов МБ, Остроушко   АА, Миронов КО, Есьман АС, Осина НА, Боднев СА, Комиссаров АБ, Даниленко ДМ, Богун АГ, Скрябин ЮП, Лопатовская КВ, Штрек СВ, Волынкина АС, Гладких АС, Котова ВО, Водопьянов АС, Новикова НА, Сперанская АС, Самойлов АЕ, Неверов АД, Шпак ИМ. COVID-19: эволюция пандемии в России. Сообщение II: динамика циркуляции геновариантов вируса SARS-CoV-2. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2022;99(4):381–396. doi: 10.36233/0372-9311-295

Бакланова ОВ, Федорова ЛС, Лопатина ОА, Бидевкина МВ, Гущина ЕА, Суетина ИА, Лисицын ФВ, Ковалевский СА, Далидчик ФИ, Мезенцева МВ. Токсикологическая характеристика и бактерицидные свойства гетерополикислот Кеггина. Гигиена и санитария. 2022; № 1: 87-94. doi: 10.47470/0016-9900-2022-101-1-87-94


>