научный сотрудник
Проведены исследования структурно-функциональных взаимосвязей мембрано-активных токсинов (кардиотоксинов из яда змей Dubovskii, ,.., Konshina, Efremov et al., 2022; Konshina et al., 2020; Konshina et al., 2011) и синтетических антимикробных пептидов (а-спиральных Lohan, Konshina, Efremov et al., 2022, кольцевых Lohan, Konshina et al., 2022; El-Mowafi, Konshina, Efremov, et al., 2023). Выявленные различия в особенностях конформационного поведения пептидов и модах взаимодействия их с липидным бислоем коррелируют с различиями в функциональной активности данных биомолекул. Помимо скрининга и отбора наиболее перспективных антибактериальных молекул-прототипов изучение структурно-функциональных взаимосвязей близких по аминокислотному составу пептидов важно для отработки технологии направленного дизайна и получения новых пептидов с заданным функционалом.
На основе комплексного подхода, включающего молекулярное моделирование и ЯМР спектроскопию, изучены структурно-динамические параметры альтернативных вариантов синтетической биологически активной конструкции, содержащей HER2- и Alb-связывающие домены (Konshina, Bocharov, Efremov et al., 2024) Анализ интерфейсов димеризации доменов в составе конструкции показал, что доступность сайтов связывания с молекулами мишенями (онкорецептором HER2 и Альбумином) в составе доменов зависит от порядка следования доменов в химере и длины соединяющего их линкера. Это позволило выдвинуть гипотезу, объясняющую сниженный фармакологический потенциал одного из вариантов химеры.
Статьи в реферируемых журналах: 17
Суммарный индекс цитирования (Web of Science, 01.03.2025): 347
Индекс Хирша (ISI Web of Science): 10