Ефремов Д.Д.
Роман Гербертович

Должность

зав. лабораторией, ведущий научный сотрудник

Научная степень, звание

доктор физико-математических наук, профессор

Член редколлегий журналов

• Биологические мембраны (зам. главного редактора)
• Биоорганическая химия
• International Journal of Molecular Sciences

Основные научные результаты

• Разработаны новые вычислительные подходы к исследованию пространственной структуры и динамики клеточных мембран и молекул белков в среде, к анализу функционально-важных механизмов взаимодействий белков с лигандами, другими белками, биомембранами.
• Впервые установлена определяющая роль мембраны в олигомеризации трансмембранных доменов белков, созданы вычислительные методы анализа явлений "мембранного ответа".
• Впервые предложены новые высокоэффективные критерии и алгоритмы выбора корректных решений в задачах компьютерного молекулярного докинга "белок-лиганд", предложена оригинальная вычислительная технология «динамического молекулярного портрета» биообъектов – комплекс методов детального картирования и анализа пространственно-временных свойств биомолекулярных систем.
• Впервые разработаны основы спектроскопии гигантского комбинационного рассеяния мембранных белков, исследованы структурно-динамические характеристики ряда родопсинов.
• Создана молекулярно-биофизическая вычислительная платформа для изучения клеточных мембран и белков, а также для рационального компьютерного дизайна новых биологически активных молекул с заранее заданными свойствами — потенциальных лекарств, действующих на мишени в мембранах клеток.
• Предложена концепция т.н. «динамического молекулярного портрета» — вычислительной технологии.

Руководство научными проектами (2021–2025) 

• «Управление димеризацией сиалидазы NEU1 как перспективный метод лечения атеросклероза». Грант РФФИ, 2018-2021 гг.
• «Молекулярно-биофизические аспекты олигомеризации мембранных доменов рецепторов, определяющие клеточную сигнализацию в норме и онкогенезе», грант РНФ, 2018-2022 гг.
• «Динамический «молекулярный портрет» клеточной мембраны и его биологическая роль». Грант РФФИ, 2019-2021 гг.
• «Молекулярно-клеточные механизмы онкологических, иммунных, метаболических заболеваний, моделирование и экспериментальное обоснование методов репрограммирования и онкотаргетинга». Соглашение с Министерством науки и высшего образования РФ (рук. направления), 2020-2022 гг.
• «Молекулярно-биофизическая платформа для изучения мембранных белков: роль олигомеризации и белок липидных взаимодействий». Грант РНФ, 2023-2025 гг.
• Онкотераностика и проблемы резистентности к противоопухолевым и антибактериальным препаратам». Соглашение с Министерством науки и высшего образования РФ (рук. направления), 2024-2025 гг.

Научные публикации

• Статьи в реферируемых журналах: 236
• Главы в сборниках: 27
• Монографии: 1
• Патенты: 3
• Свидетельства о регистрации программ для ЭВМ: 3
• Суммарный индекс цитирования (Web of Science, 01.03.2025): 3855
• Индекс Хирша (ISI Web of Science): 36