Программа "РИФ"

Получено свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ 

РИФ (Референс-независимая Идентификация генетических Фрагметов)

Номер регистрации 
2026692319

Реферат

Программа представляет собой комплекс программных конвейеров для сравнительного анализа метагеномных данных и выявления генетических последовательностей, распространенность которых повышена в одном наборе образцов относительно другого. Обработка данных включает сборку метагеномных последовательностей, анализ покрытия, сравнение распространенности k-меров, кластеризацию последовательностей по нуклеотидному сходству и анализ их распределения в пространстве признаков геномной языковой модели. Программа предназначена для научных исследований специалистами в областях биоинформатики, молекулярной эпидемиологии и геномного мониторинга, и не рекомендуется к использованию в диагностических, лечебных или иных клинических целях.

Язык программирования

Python,  Bash, Snakemake

Объем программы

151138 Байт

Авторы

А.И. Манолов, В.В. Панова, Н.С. Попов, Д.Е. Федоров

Правообладатель

Федеральное бюджетное учреждение науки "Научно-исследовательский институт системной биологии и медицины" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (RU)