В журнале Microorganisms опубликована статья сотрудников НИИ СБМ “Gene Silencing through CRISPR Interference in Mycoplasmas”. В работе авторы создали систему на основе CRISPR-интерференции для репрессии экспрессии генов в микоплазмах.
Мы показали, что выбранные детерминанты экспрессии обеспечивают уровень dCas9, который не влияет на скорость роста микоплазмы. Впервые был описан протеомный ответ бактерии с редуцированным геномом на экспрессию экзогенного dcas9. Функциональность полученной системы была подтверждена на примере трех генов, кодирующих факторы регуляции транскрипции - fur, spxA, whiA, а также гена hup1, кодирующего гистоноподобный белок у Mycoplasma gallisepticum. В результате уровень экспрессии каждого гена был снижен в десятки раз, что повлияло на уровень мРНК предсказанных мишеней транскрипционных факторов. Чтобы проиллюстрировать универсальность этого вектора, мы провели нокдаун гена deoA у представителя другого кластера рода Mycoplasma – Mycoplasma hominis. Разработанная система CRISPRi является мощным инструментом для выявления функционирования важных генов, расшифровки регуляторных сетей у микоплазм.